Skenery metra objevují mikrobní les a tisíce nových druhů

Týmy vědců a dobrovolníků se rozšířily napříč systémy hromadné dopravy v 60 městech a od roku 2015 do roku 2017 shromáždily tisíce vzorků. Prozkoumali různé povrchy, včetně turniketů, zábradlí, pokladen a sedadel uvnitř tranzitních stanic a vozů metra. (V několika městech bez systémů metra se týmy zaměřily na autobusový nebo vlakový systém.)

Mise vědců k odběru základních vzorků často přitahovala pozornost. Někteří cestující byli tak zvědaví, že se připojili k dobrovolnickému průzkumnému sboru, zatímco jiní trvali na tom, že nikdy nechtěli vědět, co žije v pólech metra. Cestující někdy nepochopili, co vědci dělali s jejich malými šmouhami. „Jeden z mužů nám nadměrně poděkoval za to, že jsme vyčistili metro,“ řekl doktor Mason.

Vědci také shromáždili vzorky vzduchu z dopravních systémů v šesti městech – New Yorku, Denveru, Londýně, Oslu, Stockholmu a Hongkongu – aby získali průvodní dokument o „atmosférickém mikrobiomu“, který byl Bylo vydáno ve středu v Microbiome.

„To je obrovské,“ řekla Erica Hartmanová, mikrobiologka z Northwestern University, která se studie nezúčastnila. „Počet vzorků a geografická rozmanitost vzorků – to je bezprecedentní.“

Poté tým extrahoval a sekvenoval DNA z každého vzorku, aby určil, jaké druhy obsahuje. Celkově ve všech povrchových vzorcích našli 4 246 známých typů mikroorganismů. Dvě třetiny z nich byly bakterie a zbytek tvořila směs hub, virů a jiných druhů mikrobů.

Ale to byl jen začátek: Našli také 10 928 virů a 748 druhů bakterií, které nikdy nebyly zdokumentovány. „Vidíme, že to byly skutečné – jsou to mikroorganismy – ale nejsou nikde v žádné databázi,“ Řekla Daniela Bezdan, bývalá generální ředitelka společnosti MetaSUB, která je nyní asistentkou výzkumného pracovníka ve Fakultní nemocnici Tübingen v Německu.

Odborníci uvedli, že drtivá většina těchto organismů by pro člověka představovala malé riziko. Téměř všechny nalezené nové viry, řekl Dr. Danco, byly pravděpodobně fágy nebo viry, které infikují bakterie. Genetická sekvence navíc nemůže rozlišovat mezi mrtvými a živými organismy a neexistuje sterilní prostředí. Naše těla ve skutečnosti závisí na bohaté a dynamické komunitě mikrobů, aby správně fungovala.