DNA odhaluje dosud největší lidský rodokmen starý 100 000 let

Výzkum vedený vědci z Institutu velkých dat na Oxfordské univerzitě kombinuje lidské genomy z různých zdrojů – starověké i moderní DNA – s cílem lépe porozumět lidské historii a vývoji.

Stejně jako rodokmen ukazuje, jak je jedinec příbuzný se svými rodiči nebo sourozenci, je dědičný Vedoucí autor Anthony Wilder Wons, nyní postdoktorandský výzkumný pracovník na Broad Institute na MIT a Harvardu, řekl CNN, že genealogie odhaluje geny, které mají dva lidé společné.

Jako takový může ukázat, které body v lidském genomu jednotlivci sdílejí geny a kde se liší.

„Jednoduše řečeno, to, co jsme udělali, je, že jsme vytvořili největší lidský rodokmen vůbec,“ řekl Wons. „Máme jedinou linii, která sleduje předky celého lidstva a ukazuje, jak jsme dnes všichni příbuzní.“

Zdroj znamená, že kdokoli s přístupem k jejich genetickým informacím může zjistit, kdy se jejich předci přestěhovali na určité místo a proč mají určité geny.

„Je to v podstatě pochopení celého příběhu lidské historie zapsaného v našich genech,“ řekl Wohns.

Lidský genetický výzkum se v posledních desetiletích rychle rozvíjel a generoval obrovské množství nových informací. Nové techniky v analýze starověké DNA poskytly vzrušující podrobnosti o prehistorických dobách a v roce 2010 to explozivně odhalily Lidé se snoubili s neandrtálci.

Ukázalo se však, že je obtížné kombinovat různé databáze, sloučit staré a moderní genomy a najít způsoby, jak naložit s tak velkým množstvím dat.

Oxfordský tým vyvinul algoritmy, které umožňují začlenění genomu do jejich nástroje.

„To byla jedna z našich největších inovací,“ řekl Wons.

To jim podle něj umožnilo vybudovat strukturu toho, co nazývali „lidská genetická genealogie“, o které se teoreticky mluvilo téměř 30 let.

„V podstatě se snažíme prolomit závoj a uvidíme, jak to vypadá,“ dodal.

V současné době byly geny 3 609 lidí sekvenovány z 215 skupin, z nichž některé jsou staré více než 100 000 let. Tato metoda umožňuje v budoucnu rozšířit tento počet na miliony genomů.

READ  Ha! Nejbližší pohled na Jupiterův měsíc v oceánu Europa před 22 lety

Článek potvrzuje současné závěry o historii lidstva, včetně toho, že většina evoluce člověka se dříve odehrávala v Africe velký Wohns řekl, že pohyb z kontinentu byl asi před 70 000 lety.

Nová studie zjistila, že jednovaječná dvojčata nejsou vždy geneticky totožná

„Je to potvrzení v mnoha ohledech,“ řekl s tím, že data ukazují, že nejvíce genetické diverzity je v Africe a že nejstarší lidští předci jsou na kontinentu. „Je jasné, že většina lidské evoluce se odehrála v Africe.“

„První návrh“ genetické genealogie

Data však také vyvolávají otázky.

„Naznačuje to neznámé migrace, ke kterým došlo v minulosti,“ řekl Wons.

Například existují určité důkazy, že předci člověka byli v Severní Americe dříve, než se dříve myslelo, i když k odhalení neznámých migrací je podle něj zapotřebí více výzkumu.

Wens přirovnal výzkum k „prvnímu návrhu“ lidské genetické genealogie a řekl, že více práce by pomohlo, aby byl přesnější a komplexnější.

Přidání dalších genomů k tomu pomůže, ale abychom dosáhli úplné přesnosti, potřebujeme získat genom každého člověka, který kdy žil, řekl, což není možné.

Studie říká, že běžné genetické testování je často chybné při identifikaci vzácných variant způsobujících onemocnění, jako jsou BRCA1 a BRCA2

Wohns řekl, že doufá, že další výzkumní pracovníci v této oblasti využijí zdroj, který je k dispozici ke stažení spolu s návodem k použití, jako základ pro zodpovězení konkrétnějších otázek o migraci v určitých geografických oblastech.

„Bude to opravdu bohatý zdroj pro budoucí vyšetřování historie lidské evoluce,“ řekl.

Wons sám spolupracuje s výzkumníky AI, aby se pokusili získat přesnější odhady, kdy a kde žili lidští předci.

Metodu lze také použít k vývoji genealogie jakéhokoli organismu, včetně nemocí, jako je SARS-CoV-2, koronavirus, který způsobuje Covid-19, a Wohns plánuje studovat vztah mezi genetikou a nemocí.

Noviny vyšly ve čtvrtek v časopise vědět.

„Velký příslib“ evolučních studií

Anders Bergstrom, postdoktorand v oboru evoluční genomiky na Francis Crick Institute v Londýně, řekl CNN, že studie poskytuje nový způsob, jak odhadnout, jak spolu souvisí naše DNA.

READ  Zkamenělé ryby odhalují nejstarší dříve známé „čelisti“

„Odvozování stromových linií spojujících DNA mezi různými lidmi je svatým grálem genomiky. Nikdy to nebude plně vyřešeno, ale tato nová výpočetní metoda dělá v tomto problému důležitý krok vpřed,“ uvedl e-mailem.

„Genealogie, kterou vyvozují, poskytuje neuvěřitelně bohatý vhled do lidské genetické rozmanitosti a historie. V genomice je nyní mnoho vzrušení ohledně mnoha možností, které tyto nové výpočetní přístupy nabízejí.“

Pontus Skoglund, vedoucí skupiny Ancient Genome Laboratory v Institutu Francise Cricka, řekl CNN, že studie ukazuje, že tento typ přístupu se může rozšířit na velké databáze.

„Proto mají velký příslib přínosu pro lékařskou genetiku a evoluční studie a tento dokument je obrovským krokem vpřed k tomu,“ řekl Skoglund e-mailem.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna. Vyžadované informace jsou označeny *